壳寡糖本身是一个带有氨基的生物多糖，含有丰富的C、N元素, 可被微生物分解利用并作为植物生长的养份。
壳寡糖可改变土壤微生物区系, 促进有益微生物的生长，并抑制一些植物病原菌和杀灭线虫及线虫卵。
壳寡糖可刺激植物生长，使农作物和水果蔬菜增产丰收。壳寡糖可诱导植物的抗病性, 对多种真菌、细菌和病毒产生免疫和杀灭作用，对小麦花叶病、棉花黄萎病、水稻稻瘟病、番茄晚疫病等病害具有良好的防治作用。
壳寡糖在农业上应用具有微量(PPM级)、高效、低成本、无公害等特点，对我国农业可持续性发展具有重要意义。
农业专用壳寡糖溶液，作为叶面肥以及生物农药已经在我国进行了大面积的推广应用，取得了良好的效果。